有性身份识别障碍的孩子到了青春期，就会爱上与自己生理性别相同的同性，因为在心理的感觉上，他（她）们是认为自己是“异性”的，这也是很多“同性恋”产生的重要原因。
那么，导致性身份识别障碍的原因是什么呢？
首先，有生理和先天遗传的因素，比如性染色体、性激素出了问题或者有的男孩天生就长的俊秀、性格文静，而女孩天生就多动，长的粗实。
另外，家庭的教养和态度对孩子的性心理发育的影响是很大的，这也是作为家长应该特别要注意的问题。像大亮的父母，从小就把大亮当成女孩来养育，并且鼓励大亮表现出女孩的行为举止，大人导演的是“假”戏，孩子却是“真”做了。久而久之，孩子从外表到内心世界都融进异性角色而忽略了自己本来应该归属的性角色。还有的家庭重男轻女，由于没有生出男孩，就将女儿当成儿子来养，给女孩穿男孩的衣服，鼓励女儿粗犷豪放的性格，也喜欢看孩子和男孩子一起打闹，这样的女孩长大了会表现出明显的男孩气质或者自认为自己就是男孩。这样的后果，完全是由父母的不当教育一手制造出来的。在第三章“‘伪娘’有可能被家庭教养出来的”章节里，曾经重点谈到了这个性别教育问题，可以参看相关内容。