由此可见，科学归纳推理法虽然对破案有重要作用，但同时也有一定的局限性。通过这种归纳推理法得到的结果在方向上是正确的，在细节上却是不足的。想要更深一步地得到确切结果，还要结合其他的归纳推理法，比如求因果归纳推理法。
凡事都有因果，比如睡眠不足驾车发生车祸，睡眠不足驾车是车祸的因，车祸是睡眠不足驾车的果，两者之间有必然的联系，这种是最明显的因果关系。还有一些不十分明显的因果，则要经过调查和推敲才能弄明白。比如服务生下毒毒害死者的案子中，单从服务生与死者的关系上来看，两人之间不曾有过接触，更涉及不到仇恨，那么服务生自然没有杀人动机，也就不会被列为嫌疑人。事实也正是如此，虽然药是服务生放的，但他并没有杀人的念头，而且丝毫不知道自己做的事会使人致死。然而，将另一个与两人都有关的人放入其中，这两人就有了间接的联系。如果不是死者生意上的对手想要偷窃死者的机密文件，或者如果放的药并不会让人致死，只是昏睡，死者就不会死，而他的对手即使被警方抓住，也不过会被判偷窃罪。如果服务生不是对手的朋友，他就不会不小心成了杀人的帮凶。