对于蒋介石垄断权力、控制军队的做法，桂系虽无可奈何，但也不时发起反击。桂系的主张在一定程度上得到广东军政当局，如薛岳、余汉谋等人的支持，他们策动属下以民意代表身份，批评军事措施之不当，要求撤销参谋总长顾祝同的职务。9月1日，国民党中央非常委员会开会检讨战局，李宗仁发言称：“欲打开此沉闷局面，必须灵活运用军事力量，使能反败为胜。……保卫广东，首贵统一指挥，决战应积极做去，不可延误。但部队不听调度，即无法完成部署。”他指责说：胡琏兵团原在赣南，归华中指挥，不知奉何人命令，调到广东东江，这命令显然不对。他提出今后大的决策应请总裁指示，小的如军队调动等，应听国防部命令，因为总裁说过他领导党，不问政事，此类事件当非总裁之意，其症结何在，责任何属，实难揣测；原订战略不能执行，政府又如何做事。不过这是李宗仁自说自话，蒋介石从来不认为军队调动是小事，军权是蒋必须时时控制在手的。