但是在谈判的过程中却出现了一个问题，因为电脑软件是由操作系统、程序语言、应用软件三大类组成的，而微软公司只有BASIC语言，却没有现成的操作系统。可IBM公司则要求把操作系统一同买过来掌握在自己手里。而操作系统是属于基尔代尔数据研究公司的。比尔·盖茨和基尔代尔之间早已经达成默契，微软公司不会涉足操作系统领域，同时数字研究公司也不会进行程序语言的研究。因此，比尔·盖茨只能打电话给基尔代尔，说这里有一个非常重要的客户希望能和他们公司合作。于是，基尔代尔让IBM公司第二天到他们公司进行商谈。
如此一来，虽然比尔·盖茨非常希望能和IBM公司做成这笔生意，却觉得没指望，因为主动权已经交到了基尔代尔手中。但谁也没想到基尔代尔竟然放过了一次这么重要的机会——第二天基尔代尔并没有亲自与IBM公司的人会面，而是派他的妻子出面进行了接待。当IBM公司的代表提出要和他们先签署一份保密协议再进行合作谈判时，基尔代尔的妻子动摇了——在她看来，在不清楚对方的真实意图的情况下就签下这份保密协议太过被动了，而且她怕自己的公司及其软件产品会受到IBM的控制。由于基尔代尔的妻子不肯签署那份保密协议，于是谈判陷入了僵局。对此IBM公司的代表非常生气。他们认为这么大的公司来找你们合作，你们竟然怀疑我们的动机和诚意，与其在这里浪费时间，不如找其他的公司，于是，IBM公司当即返回了西雅图找到了微软公司。就这样，机会又重新回到了比尔·盖茨的手中。于是，比尔·盖茨马上决定替IBM公司开发操作系统，并向IBM公司提交了一份可行性报告。随后微软便和IBM签订了合同。